Se trataría de un problema NEUROENDOCRINO por afectación del hipotálamo o de la hipófisis .
Cursa con TSH normal o baja y T4 libre baja. El hipotiroidismo central es mucho menos frecuente que el el hipotiroidismo primario y se debe a una falta de secreción apropiada de TSH ya sea por causa de poca producción de TSH en la hipófisis o por causa de bajo estímulo de TRH desde el hipotálamo.
La hiposecreción de TSH se acompaña en la mayoría de los casos de déficit de otras hormonas hipofisarias por lo que resulta imprescindible el estudio funcional del eje hipotálamo hipofisario y la realización de técnicas de imagen que orienten hacia la patología concreta.
La deficiencia de TSH puede ocurrir por destrucción de las células tirotropas por tumores
hipofisarios funcionantes y no funcionantes o después del tratamiento quirúrgico o radioterápico de esos tumores,
en el panhipopituitarismo postparto (síndrome de Sheehan), craneofaringioma, aneurisma de carótida, traumatismo, hemocromatosis, hipofisitis linfocitaria, procesos infiltrativos hipofisarios y defectos del gen de la subunidad beta de TSH.
Las patologías hipotalámicas que provocan hipotiroidismo central incluyen: radiación craneal, traumatismo, lesiones infiltrativas, neoplasias del hipotálamo y lesiones hipofisarias que interrumpen la circulación portal hipotálamo-hipofisaria.
En general, en los pacientes con hipotiroidismo hipofisario la respuesta de TSH a la prueba de TRH es discreta, mientras
que en el hipotiroidismo hipotalámico dicha respuesta es normal o está retrasada, aunque existen importantes diferencias individuales en el resultado de la prueba. 
